中国古代医家根据金、木、水、火、土之五行的运行和风、热（暑）、湿、火、燥、寒之六气的流转，以推断气候变化与疾病发生的关系。五行的运行就是五运，六气的流转就是六气。以五运配十天干，以六气配十二地支。
《易传·说卦传》第十章:“乾天也，故称父，坤地也，故称母；震一索而得男，故谓之长男；巽一索而得女，故谓之长女；坎再索而男，故谓之中男；离再索而得女，故谓之中女；艮三索而得男，故谓之少男；兑三索而得女，故谓之少女。”
《钟吕传道集》论天地第三：“天以行道，以乾索于坤。一索之而为长男，长男曰震。再索之而为中男，中男曰坎。三索之而为少男，少男曰艮。是此天交于地，以乾道索坤道而生三阳。及乎地以行道，以坤索于乾。一索之而为长女，长女曰巽。再索之为中女，中女曰离。三索之为少女，少女曰兑。是此地交于天，以坤道索乾道而生三阴。三阳交合于三阴而万物生，三阴交合于三阳而万物成。天地交合，本于乾坤相索而运行于道。乾坤相索而生六气，六气交合而分五行，五行交合而生成万物。”
解读：
乾为父，为纯阳，地为母，为纯阴，八卦中的其它六卦是乾坤父母所生的子卦，即阴阳两仪所生的儿女。
震卦是纯阴之坤母向纯阳之乾父索取第一爻（初爻，下爻），坎卦是索取第二爻（中爻），艮卦是索取第三爻（上爻）。巽卦是乾父向坤母索取第一爻变现，离卦是索取第二爻，兑卦是索取第三爻。其中男代表阳爻，女代表阴爻。
震、坎、艮为后天三阳卦，即长男震卦，中男坎卦，少男艮卦。巽、离、兑为后天三阴卦，即长女巽卦，中女离卦，少女兑卦。此三阴三阳卦称为六子卦。六子卦代表六气，六气合化为五行，五行生成万物，这就是八卦里的五运和六气。
二十八宿和五气经天图如下：
《素问·五运行大论篇》说：“览《太始天元册文》：‘丹天之气，经于牛女戊分；黅天之气，经于心尾己分；苍天之气，经于危室柳鬼；素天之气，经于亢氐昴毕；玄天之气，经于张翼娄胃。’所谓戊己分者，奎壁角轸，则天地之门户也。”
《素问·五运行大论篇》：“土主甲己，金主乙庚，水主丙辛，木主丁壬，火主戊癸。”就是说，甲己年为土运，乙庚年为金运，丙辛年为水运，丁壬年为木运，戊癸年为火运。
《素问•天元纪大论》：“闻之者，闻之上古也。甲己化土，故甲己之岁，土运统之；乙庚化金，故乙庚之岁，金运统之；丙辛化水，故丙辛之岁，水运统之；丁壬化木，故丁壬之岁，木运统之；戊癸化火，故戊癸之岁。火运统之。”
解读：
在传统文化和古代天文学中，八卦的巽位,地支的辰巳位，二十八宿的奎壁两宿位，天干的己位称地户；八卦的乾位，地支的戌亥位，二十八宿的角轸两宿位，天干的戊为称天门。戊为阳土，己为阴土。天顷西北，地不满东南。在后天八卦中西北为乾，东南为巽。
天上二十八宿间有似云似雾的五色气，即黄色土气（黅天之气），红色火气（丹天之气），白色金气（素天之气），苍色木气（苍天之气），黑色水气（玄天之气）的五天之气。这五色之气各流布于有关各宿。
戊分包含奎壁两宿，丹天离火之气经过牛女和奎壁，此四宿对应于天干的戊癸，故戊癸合化为火，而说火主戊癸。
己分含角轸两宿，黅天艮土之气经过心尾和角轸四宿，此四宿对应于天干的甲己，故甲己合化为土，而说土主甲己。
苍天之木气经过危室和柳鬼，此四宿对应于天干的丁壬，故丁壬合化为木，而说木主丁壬。素天之金气经过亢氐和昴毕，此四宿对应于天干的丙辛，故乙庚合化为金，而说金主乙庚。甲己年为土运，乙庚年为金运，丙辛年为水运，丁壬年为木运，戊癸年为火运。这就是气候上的五行运转规律，称为五运，五运与十天干对应。
十天干配五气，因为四象从土中出，故以甲己首先合化为土，甲年和己年皆为土运年，再按土生金，金生水，水生木，木生火的规律排列，即得到乙庚合化金，丙辛合化水，丁壬合化木，戊癸合化火。即甲、乙、丙、丁、戊分别配土、金、水、木、火，然后己、庚、辛、壬、癸再分别配以土、金、水、木、火，这样就得到天干合化的规律，也就把五运和年干联系起来了。
《黄帝内经·素问·天元纪大论》:“鬼臾区曰：阴阳之气各有多少，故曰三阴三阳也……鬼臾区曰：寒暑燥湿风火，天之阴阳也，三阴三阳上奉之。木火土金水火，地之阴阳也，生长化收藏下应之。”
解读：
六气在天，分别体现出寒暑燥湿风火六种特征,称之为天之阴阳，天有三阴三阳，而五行之木火土金水为地之阴阳。
《素问·天元纪大论》:“子午之岁,上见少阴;丑未之岁,上见太阴;寅申之岁,上见少阳; 卯酉之岁,上见阳明;辰戌之岁,上见太阳;巳亥之岁,上见厥阴。
《素问·天元纪大论》：“帝曰：其于三阴三阳，合之奈何？鬼臾区曰：子午之岁，上见少阴；丑未之岁，上见太阴；寅申之岁，上见少阳；卯酉之岁，上见阳明；辰戌之岁，上见太阳；巳亥之岁，上见厥阴。少阴所谓标也，厥阴所谓终也。”
解读：
将十二年支与六气相对应。将亥子丑分别见三阴，寅卯辰分别见三阳。即亥见厥阴、子见少阴、丑见太阴，寅见少阳、卯见阳明、辰见太阳。
前面六个年支见三阴三阳，后面的六个年支也依次见三阴三阳。巳午未分别见三阴，申酉戌分别见三阳。即巳见厥阴，午见少阴，未见太阴。即申见少阳，酉见阳明，戌见太阳。
年支和六气图如下：
《素问·天元纪大论》：“故神在天为风者，在地即为木；神在天为热者，在地即为火；神在天为湿者，在地即为土；神在天为燥者，在地即为金；神在天为寒者，在地即为水。风热湿燥寒，无形之气也，故在天为气。木火土金水，有象之形也，故在地成形。在地之形，与在天之气相感，而化生万物矣。”
《黄帝内经•素问·天元纪大论》：“厥阴之上，风气主之；少阴之上，热气（君火）主之；太阴之上，湿气主之；少阳之上，相火主之；阳明之上，燥气主之；太阳之上，寒气主之。所谓本也，是谓六元”
《黄帝内经•素问•至真要大论》“帝曰：愿闻其道也。岐伯曰：厥阴司天，其化以风；少阴司天，其化以热；太阴司天，其化以湿，少阳司天，其化以火；阳明司天，其化以燥；太阳司天，其化以寒。以所临脏位，命其病者也。”
解读：
六气中的五气与五行对应。神在天为气，即为六气，在地成形，即为金木水火土。在六气中，五行中的离火分出了两种气，一个称为暑（热）气，也称君火，另外一个称为火，即相火。这样五气就变成了六气。
厥阴（巳亥）为风，少阴（子午年）为热（暑），太阴（丑未年）为湿，少阳（寅申年）为相火，阳明（卯酉）为燥，太阳（辰戌）为寒。将六气配上五行，就称厥阴风木，少阴君火（热），太阴湿土，少阳相火，阳明燥金，太阳寒水。
《黄帝内经.素问》六微旨大论：“少阳之上，火气治之，中见厥阴；阳明之上，燥气治之，中见太阴；太阳之上，寒气治之，中见少阴；厥阴之上，风气治之，中见少阳；少阴之上，热气治之，中见太阳；太阴之上，湿气治之，中见阳明，所谓本也。本之下，中之见也，见之下，气之标也。”
解读：
所谓三阴是一阴（厥阴）、二阴（少阴）、三阴（太阴）；所谓三阳是一阳（少阳）、二阳 （阳明）、三阳（太阳）。
一阳为长男震雷，为少阳相火，震木为少阳，震为雷，雷中藏火，故为相火。
二阳为兑金，为阳明燥金。兑虽为少女卦，但其阳气盛于震卦，故取为二阳。
三阳为坎水，为太阳寒水，坎水中藏乾金，乾为三阳。
一阴为巽风，为厥阴巽风，巽木为风。
二阴为离火，为少阴君火。
三阴为坤土，为太阴湿土。
这里的三阴三阳不是完全用简单代表三阴三阳的六子卦，六气的中卦也能基本代表阴阳的升降，且更能代表阴极而阳和阳极而阴的规律。